新沂历史悠久，1万年前石器时代，这里已有人类活动的踪迹。
5000多年前，著名的花厅古文化就在这块美丽富饶的土地上发祥，这里是北方大汶口文化和南方良渚文化交流融汇的重要区域。
东周时期，这里是钟吾子爵封地，名为“钟吾国”。
秦时建司吾、建陵两县。
东汉时复为司吾县。
南北朝时废司吾县地入宿豫县。
唐代宗元年（公元762年）宿豫县易名为宿迁县，属徐州彭城郡。
五代时与唐朝的隶属关系相同。
宋属河东路淮阴军邳州郡，后属京东东路淮阳军。
元、明、清时期属淮安府。
清朝初年为江南省的一部分。
康熙六年（1667年）分江南省为江苏、安徽二省，属江苏省淮安府。
清初，改属徐州。
辛亥革命以后，中华民国成立，废除州府制，直属江苏省政府，后划归淮阴专署。
在人民革命斗争中，成立的泗宿县、宿迁县归华中军区六分区领导，属淮海区。
解放后，仍隶属淮阴专区，原宿迁北部沂河以北划归宿北县（今新沂市），宿迁县的规模比以前缩小。直至1940年8月，为了适应抗日战争形势之需要，在潼阳境内建立了沭（阳）宿（迁）海（东海）联防办事处。
1942年4月建立苏北办事处。
1943年8，9月份，分别析置潼阳、宿北二县。
1949年，由宿北县的大部分地区及潼阳的五个区（颜集、阴平、庙头等仍归沭阳县）合并成立新安县，属苏北行政区淮阴专区。后因于河南省新安县重名，于1952年经政务院批准，易名为新沂县（以境内新开新沂河命名）。
1953年后，新沂由淮阴专区划入徐州专区。
1983年3月，地、市合并，新沂成为徐州六县之一，政府设在新安镇。
1990年2月撤县建市，新沂共辖26个乡镇；
1998年新沂的中等城市规划通过国务院审批。
2015年3月，国家发改委下发《国家发展改革委办公厅关于开展中小城市综合改革试点工作的通知》，新沂成为国家中小城市综合改革试点地区.
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